Существует два метода контроля толщины покрытия: в неотвержденном («сыром») и отвержденном (полимеризованном) состояниях. Измерение толщины покрытия в сыром состоянии необходимо в том случае, когда измерение полимеризованного покрытия невозможно, например, при высокой плотности монтажа компонентов, препятствующей проведению измерений.
Для оценки толщины используются специальные щупы. Они имеют зубья различной длины, при опускании в защитную пленку из лака смоченные концы щупа показывают примерную толщину покрытия. Чтобы выяснить, какая толщина получится после отверждения, нужно пересчитать полученные данные с учетом процентного содержания твердых частиц в материале. Например, если процентное содержание твердых частиц составляет 35% (с учетом подбора вязкости растворителем), тогда толщина пленки после отверждения составит примерно 35% от измеренной величины (такой расчет является примерным и может отличаться для различных материалов).


Для измерения толщины отвержденного покрытия применяются обычные микрометры. Для работы с ним необходимо иметь плоскую (свободную от компонентов) поверхность печатной платы, на которой возможно провести измерения. Замеряется толщина ПП сначала до нанесения, а потом после отверждения покрытия. В результате определяется толщина покрытия. Точность измерения таким прибором составляет ±10 мкм.
Существуют более точные приборы, которые могут измерить толщину влагозащитного покрытия, нанесенного на немагнитную металлическую основу по методу вихревых токов с точностью до ±1 мкм. Такой основой может служить медь, олово, финишное покрытие на ПП, корпуса или выводы элементов.